По мере ухудшения эпидемической ситуации религиозные организации в разных регионах стали вновь вводить ограничения, снятые ранее.
8 октября Федерация еврейских общин России объявила об усилении мер безопасности в синагогах и обязала руководителей общин следить за соблюдением масочного режима и соблюдением дистанции. Традиционные для праздника Симхат-Торы танцы со свитками Торы решено было проводить не так, как всегда: верующие должны стоять на месте, а несущий священную книгу человек – перемещаться по залу. Московская хоральная синагога призвала верующих старше 65 лет оставаться дома.
9 октября митрополит Смоленский и Дорогобужский Исидор (Тупикин) приостановил проведение богослужений в кафедральном Успенском соборе и призвал паству соблюдать масочный режим и не прикладываться к святыням.
12 октября глава синодального Отдела внешних церковных связей митрополит Волоколамский Иларион (Алфеев) также призвал паству соблюдать профилактические меры, заметив при этом, что многие посетители Троице-Сергиевой лавры, которым на входе выдаются одноразовые маски, не желают их надевать.
14 октября стало известно, что в Тюменской области закрыты для мирян следующие монастыри: Свято-Троицкий мужской, Богородице-Рождественский женский, Свято-Знаменский Абалакский мужской и Иоанно-Введенский женский. В Татарстане закрыт для мирян Раифский монастырь. Его решили закрыть на десять дней. В Липецкой области закрыт Задонский Богородице-Рождественский мужской монастырь.
14 октября стало известно, что в Энгельсе Саратовской области в связи с пандемией отменен крестный ход, традиционно проводившийся в честь праздника Покрова.
Намеченный на 27-29 октября Освященный собор Русской православной старообрядческой церкви решено было отменить в связи с пандемией.
14 октября митрополит Тобольский и Тюменский Димитрий (Капалин) связал отказ от ношения масок и выполнения прочих санитарных мер с грехом гордыни. «Соблюдение санитарных мер — это вопрос послушания Церкви и послушания заботящимся о нашем здоровье врачам. Помните, что непослушание — это грех противления, это своеволие, это гордыня», — сказал владыка.
19 октября муфтий Татарстана Камиль Самигуллин призвал местных имамов сократить время пятничного намаза на 10-15 минут, чтобы избежать вспышки заболевания в мечетях.
«Тем же, кто опасается инфицирования, считаю допустимым покинуть мечеть после обязательной (фарз) молитвы и приветствия», — сказал муфтий и напомнил о необходимости ношения масок и использовании в мечетях только личных молитвенных ковриков.
22 октября Раифский Богородицкий мужской монастырь в Татарстане открылся для паломников после десятидневного карантина. 12 октября монастырь был закрыт для посещения верующих в связи с тем, что у двух насельников было подозрение на COVID-19. По словам наместника монастыря игумена Гавриила (Рожнова), те двое вылечены и находятся на карантине, у остальных насельников тесты на коронавирус оказались отрицательными.
Духовное управление мусульман Тюменской области приостановило проведение коллективных намазов в мечетях с 24 октября по 7 ноября, однако индивидуальные молитвы в мечетях проводиться будут. Воскресные школы переведены на дистанционный режим.
25 октября стало известно, что с призывом отказа от публичных намазов и религиозных обрядов (свадеб, соболезнований) выступили муфтияты республик Северного Кавказа, в том числе Чечни.